2009年2月，退伍人员艾某与黄某商量，决定去搞一批炸药转卖牟利。同年2月26日凌晨3时许，艾某、黄某乘部队值守人员换岗之机，窜入湖北省武汉市洪山区政院路某部队废旧仓库，拿出事先准备的大号包装袋，在该仓库搬出16包炸药拆卸后分装入10个大号包装袋里，两人分批抬到仓库外面马路边上，再叫出租车运走，后临时通过韦某转卖给渔民利某，共牟利15000元。2月27日，该部队发现炸药被盗后，即由保卫部门开展调查，查实炸药失窃数量为16包1600斤，并通报当地公安机关协查。3月17日，艾某、黄某、韦某、利某被公安机关抓获，并在利某家里起获10包炸药，由侦查人员与辅警人员运回公安分局。审查中，艾某、黄某供认偷了10包炸药，韦某、利某也供认为10包，具体重量没有称量。逮捕羁押期间，犯罪嫌疑人利某因病在看守所死亡。该案应由当地公安机关立案侦查，还是应由部队保卫部门立案侦查？简述理由。公安机关与军队互涉的刑事案件，应当如何处理？