简述变性高效液相色谱法检测基因变异的优点。
正确答案:
DHPLC突变检测技术与其它方法相比,具有更高的准确性和敏感性。
(1)DHPLC与各种电泳法的比较SSCP分析片段长度<300 bp,对于人类SNP的检出率为50~95%,尤其容易漏检位于发夹结构中的变异。CSGE检测杂合子的灵敏度与SSCP相当或稍低。而DHPLC对150bp~600bp的DNA片段的突变检出率都可达到100%,且而不需要特殊的样本处理。TGGE/DGGE对于异源双链及同源双链分子的检测灵敏度高出CSGE和SSCP很多。但对于较高温度的融解区域的突变检测,DHPLC的灵敏度要高于TGGE/DGGE。
(2)DHPLC与DNA测序的比较 对于频率高于20%的变异,直接测序的检出率为80%,DHPLC的检出率可达到100%;基因突变频率低于20%时就很难用测序方法检测到,而DHPLC可从待检样品中检测到占总基因量0.5-5%的突变等位基因,且重现性很好。
(1)DHPLC与各种电泳法的比较SSCP分析片段长度<300 bp,对于人类SNP的检出率为50~95%,尤其容易漏检位于发夹结构中的变异。CSGE检测杂合子的灵敏度与SSCP相当或稍低。而DHPLC对150bp~600bp的DNA片段的突变检出率都可达到100%,且而不需要特殊的样本处理。TGGE/DGGE对于异源双链及同源双链分子的检测灵敏度高出CSGE和SSCP很多。但对于较高温度的融解区域的突变检测,DHPLC的灵敏度要高于TGGE/DGGE。
(2)DHPLC与DNA测序的比较 对于频率高于20%的变异,直接测序的检出率为80%,DHPLC的检出率可达到100%;基因突变频率低于20%时就很难用测序方法检测到,而DHPLC可从待检样品中检测到占总基因量0.5-5%的突变等位基因,且重现性很好。
答案解析:有
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